來源:公司資(zī)訊 | 2021.08.18
「本文來源:深圳商(shāng)報」
【深圳商(shāng)報訊】(記者張妍通訊員(yuán)田嬌)8月16日,“數源杯”百萬單細胞基因表達數據算法大(dà)賽在深圳國家基因庫舉行決賽,來自國内外(wài)10所高校的10組精英團隊在此展開(kāi)一(yī)場關于“BT+IT”的較量。
據了解,該賽事由深圳國家基因庫主辦,深圳華大(dà)生(shēng)命科學研究院、深圳市猛犸公益基金會、深圳市華大(dà)基因學院協辦,旨在提升單細胞聚類算法的性能。
深圳國家基因庫主任王韌表示,從2009年第1篇單細胞轉錄組測序文章橫空出世至今,短短10餘年間單細胞測序技術在生(shēng)命科學研究各層面都獲得了快速、廣泛的應用,單細胞測序技術的發展也日新月異。“随着單細胞數據的不斷産出,數據處理的通量不斷攀升,這意味着單細胞計算工(gōng)具的性能也需要不斷提升,方能滿足該領域飛速發展的需求。”
深圳國家基因庫生(shēng)命大(dà)數據平台負責人魏曉鋒表示,深圳國家基因庫本身就是以生(shēng)命大(dà)數據和大(dà)樣本存儲爲根基的國家基因庫,希望以舉辦該賽事爲契機,讓更多領域的科研人員(yuán)更好地利用相關資(zī)源,更好地挖掘相關信息。該賽事吸引了全球300餘支隊伍報名參與,累計提交作品達1819件次,最終經過初賽、複賽的嚴格評審篩選,10支隊伍入圍決賽。
“我(wǒ)們最終目的是希望推動應用,比如精準醫學、精準農業育種等。”魏曉鋒表示,該賽事産生(shēng)的算法工(gōng)具将部署到生(shēng)命大(dà)數據平台上,免費(fèi)提供給醫療機構和科研機構人員(yuán)使用。
BT指的是生(shēng)物(wù)技術,IT則是信息技術,“BT+IT”的融合則可能是下(xià)一(yī)個産業的爆發點。華大(dà)集團首席科學家、華大(dà)生(shēng)命科學研究院院長徐訊在賽事發言中(zhōng)透露,科技部的“十四五”重點研發計劃上已啓動了“BT+IT”融合項目。
徐訊認爲,“BT+IT”融合包括兩方面内容,一(yī)是利用生(shēng)物(wù)技術來突破信息技術的局限。目前,沒有任何一(yī)種存儲介質可以像DNA一(yī)樣把信息儲存上百萬年的時間,如果用AGCT4種堿基字符作爲編碼來取代計算機存儲格式,存儲年限将遠超過目前的磁介質和光介質。二是利用信息技術解決生(shēng)物(wù)技術的問題,“這就是今天比賽的内容之一(yī),而這僅僅是一(yī)個開(kāi)端。”